Qual pode ser o problema se as bandas não estão aparecendo no Western Blot?

Qual pode ser o problema se as bandas não estão aparecendo no Western Blot?
Anonim

Responda:

Muitos…

Explicação:

Existem muitas razões pelas quais as bandas podem não aparecer em um western blot. As combinações de amostra e anticorpo funcionaram no passado?

Abaixo estão alguns que eu posso pensar no momento que podem fazer com que as bandas não apareçam:

  1. A proteína foi transferida do gel? Tente manchar a membrana com algo como ponceau S ou amido black para ver se as bandas estão presentes. Às vezes, você pode ver as bandas de proteína na membrana molhando-a e mantendo-a em um ângulo com a luz.

  2. O anticorpo primário está funcionando? Este é um teste difícil de testar e a única maneira que você pode é incluir um controle positivo onde você sabe que tem a proteína de interesse presente. Se você tiver alguma proteína interessada, tente localizá-la na membrana Western blotting (ou seja, não use o gel) e veja se obtém um resultado se processar a membrana como se fosse um western blot.

  3. O anticorpo secundário está reconhecendo o anticorpo primário? Mais uma vez, difícil de testar. Sobre o único teste que você pode fazer é o teste no local mencionado acima em 2.

  4. O "sistema de detecção" está funcionando? Dependendo do método de detecção que você está usando, você pode tentar usar um pouco do anticorpo secundário para ver se a solução de detecção, e também o agente desencadeante / enzima do anticorpo secundário, está funcionando. Isto é, você pode desencadear a reação apenas com o anticorpo secundário?

Finalmente, pode ser tão simples quanto uma das soluções usadas durante a sondagem da plotagem ser feita incorretamente. Por exemplo, se a concentração de sal estiver errada no tampão, isso pode fazer com que os anticorpos sejam liberados do blot. O mesmo aconteceria também se o pH dos buffers estivesse incorreto.

A causa "mais estranha" para um western blot que não funcionou, que eu pessoalmente experimentei, foi quando trocamos o fornecedor do leite em pó que usávamos para bloquear a membrana. O pó do novo fornecedor continha uma fosfatase fosfotirosina que removeu todos os grupos fosfato que estávamos tentando detectar com nosso anticorpo antifosfotirosina.